君がいる、いた、そんな時。

小学6年生の岸本正哉（マサマヨール忠）は、フィリピンと日本のハーフの男の子。クラスのいじめっ子たちから、何かにつけてちょっかいを受けている。そんな正哉の学校でのよりどころは、優しく見守ってくれる新任司書の山崎祥子（小島藤子）と過ごす図書室だけだ。正哉と同じクラスの放送委員の香山涼太（坂本いろは）は、DJカヤマと称して必死で校内放送をしていたが皆に不評でクラスのなかでも浮いている存在だった。ある日、いつもの通り、正哉が図書室に向かうと、涼太が祥子と楽しそうに話していた。涼太はある特別放送を企画していて二人を巻き込もうとする。当然ながら、正哉は乗り気ではなかったが、祥子は涼太の企画を手伝うという。そんな彼女にはある秘密があった。ある時、その秘密を目にした涼太は、正哉に話す。自分が知らなかったことに正哉は傷つく。そして、とうとう特別放送日がやってくる。とんでもない涼太の企画を実行した祥子は謹慎処分となってしまう。そんな祥子を励ますために、正哉と涼太はある計画をたてたのだった......。